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Analyse des profils génétiques des personnes atteintes de la COVID-19 et évaluation de l’impact de l’asthme sur la sévérité de la maladie

Amri Omayma. (2023). Analyse des profils génétiques des personnes atteintes de la COVID-19 et évaluation de l’impact de l’asthme sur la sévérité de la maladie. Mémoire de maîtrise, Université du Québec à Chicoutimi.

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Résumé

La maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) est une infection virale causée par le virus du syndrome respiratoire aigu sévère du coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Plusieurs facteurs semblent amplifier la sévérité de cette maladie, y compris les maladies pulmonaires. Des études antérieures ont suggéré un lien potentiel entre la COVID-19 et l’asthme. Plus spécifiquement, il a été démontré que l'asthme non allergique est associé à un risque accru de développer une forme sévère de la COVID-19. En revanche, l'asthme allergique pourrait avoir un effet protecteur. Dans la présente étude, une étude d'association pangénomique (GWAS) a été faite à l’aide des participants de la Biobanque québécoise de la COVID-19 (BQC19) afin d’identifier des variants génétiques associés à la forme sévère de la COVID-19 en comparaison à la forme légère à modérée. Dans un deuxième temps, une analyse a été réalisée afin de comparer le profil génétique des personnes atteintes de COVID-19 sévère avec asthme à celles sans cette comorbidité. Dans un premier temps, la comparaison entre les personnes atteintes de la COVID-19 sévère et celles ayant une forme légère à modérée, a montré que les personnes ayant un phénotype sévère pour la COVID-19 avaient un âge moyen plus élevé, étaient plus souvent de sexe masculin et qu’elles avaient un indice de masse corporelle (IMC) plus élevé. De plus, ces personnes présentaient une neutrophilie et une lymphopénie, ainsi que des niveaux plus élevés de D-dimères et de C-réactive (CRP). L’analyse comparative a aussi démontré une utilisation accrue des inhibiteurs de l'enzyme de conversion de l'angiotensine (IEC) chez les personnes atteintes de la forme sévère de la COVID-19 comparativement aux personnes ayant la forme légère à modérée. De plus, les personnes ayant un asthme concomitant à une forme sévère de COVID-19 présentaient plus fréquemment un IMC supérieur ou égal à 33,70 kg/m² et un taux moins élevé de CRP. L’analyse GWAS a quant à elle permis d'associer sept variants génétiques à la COVID-19 sévère. Un de ces variants (rs5891552) se retrouve sur le gène RP1 axonemal microtubule associated (RP1) qui est impliqué dans certaines infections virales et dans le déclenchement de complications graves de ces maladies. De plus, le variant rs4960330, localisé sur le gène desmoplakin (DSP), mérite une attention particulière étant donné que des études récentes ont montré une augmentation des niveaux de la protéine desmoplakine dans les cas de COVID-19 sévère. Enfin, les analyses réalisées entre les groupes affectés par la COVID-19 sévère, avec et sans asthme, a également révélé quatre autres variants significatifs pour les gènes transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 2 (TMEFF2) et huntingtin interacting protein 1 (HIP1). TMEFF2 a été associé à une éosinophilie chez les personnes asthmatiques sévères, tandis que HIP1 pourrait être impliqué dans l'endocytose du SARS-CoV-2. Cette étude a permis de détecter des variants génétiques associées à la forme sévère de la COVID-19, en prenant compte ou non de l’asthme comme comorbidité. Cependant, des recherches supplémentaires seront requises pour mieux comprendre le rôle de ces variants dans l'évolution de ces maladies.

Type de document:Thèse ou mémoire de l'UQAC (Mémoire de maîtrise)
Date:2023
Lieu de publication:Chicoutimi
Programme d'étude:Maîtrise en sciences cliniques et biomédicales
Nombre de pages:103
ISBN:Non spécifié
Sujets:Sciences de la santé > Sciences médicales > Biologie moléculaire
Sciences de la santé > Sciences médicales > Génétique
Département, module, service et unité de recherche:Départements et modules > Département des sciences de la santé > Programmes d'études de cycles supérieurs en sciences cliniques et biomédicales
Directeur(s), Co-directeur(s) et responsable(s):Laprise, Catherine
Mots-clés:asthme, COVID-19, COVID-19 sévère, génétique, GWAS, BQC19
Déposé le:17 janv. 2025 08:30
Dernière modification:20 janv. 2025 21:29
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