Constellation, le dépôt institutionnel de l'Université du Québec à Chicoutimi

Résumé

La sensibilisation aux aéroallergènes représente un facteur de risque pour le développement de l’atopie. Il est aussi connu que les aéroallergènes d'origine intérieure (squames d'animaux, acariens, poussière) sont majoritairement associés à l'asthme allergique, tandis que les aéroallergènes d'origine extérieure (moisissure, pollens, mauvaise herbe) sont majoritairement associés à la rhinite allergique. La présente étude vise à identifier des variants génétiques communs et distincts entre la sensibilisation aux aéroallergènes d'intérieur et d'extérieur. Ceci a été possible en effectuant une étude d’association génomique (de l’anglais Genome-wide association study [GWAS]) pour la sensibilisation aux aéroallergènes d'intérieur, d'extérieur ou combinée dans la cohorte familiale d’asthme du Saguenay–Lac-Saint-Jean. Les variants associés pour chacun des types de sensibilisation ont ensuite été utilisés pour effectuer des analyses de locus quantitatif (de l’anglais Quantitative trait locus [QTL]) pour le niveau d'expression (eQTL) et de méthylation (mQTL) des gènes pour les lymphocytes T CD4+ naïfs et pour les éosinophiles provenant d'échantillons sanguins. Ainsi, les GWAS ont permis d'identifier plusieurs associations significatives (p < 1´10-5) entre des variants et les types de sensibilisations aux aéroallergènes (intérieur : 259 variants, extérieur : 38 variants et combiné : 57 variants). Ensuite, les analyses fonctionnelles (eQTL et mQTL) ont permis d'identifier des variants génétiques, préalablement associés aux trois types de sensibilisations, pour lesquels il y avait des résultats significatifs (FDR < 0,05) en cis-eQTL et en cismQTL pour les mêmes gènes, RNASET2 et MIR3939 pour la sensibilisation intérieure et FGD3 et CENPP pour la sensibilisation combinée, chez les deux types de cellules immunitaires à l’étude. De plus, les analyses de corrélation ont permis de mettre en évidence une corrélation significative (FDR < 0,05) entre la différence d’expression et de méthylation de certains gènes chez les lymphocytes T CD4+ naïfs. Ainsi, cette étude a permis d'identifier un profil génétique spécifique à chacun des types de sensibilisation aux aéroallergènes et de cibler les voies biologiques impliquées dans deux types de cellules immunitaires.