Rakesh Mohan, Vézina Hélène, Laprise Catherine, Freeman Ellen E., Burkett Kelly M. et Roy-Gagnon Marie-Hélène. (2023). GENLIB: new function to simulate haplotype transmission in large complex genealogies. Bioinformatics, 39, (3), p. 1-4.
Prévisualisation |
PDF
- Version publiée
Disponible sous licence Creative Commons (CC-BY 4.0). 928kB |
URL officielle: https://doi.org/10.1093/bioinformatics%2Fbtad136
Résumé
Abstract Summary
Founder populations with deep genealogical data are well suited for investigating genetic variants contributing to diseases. Here, we present a major update of the genealogical analysis R package GENLIB, centered around a new function which can simulate the transmission of haplotypes from founders to probands along very large and complex user-specified genealogies.
| Type de document: | Article publié dans une revue avec comité d'évaluation |
|---|---|
| ISSN: | 1367-4811 |
| Volume: | 39 |
| Numéro: | 3 |
| Pages: | p. 1-4 |
| Version évaluée par les pairs: | Oui |
| Date: | 1 Mars 2023 |
| Identifiant unique: | 10.1093/bioinformatics/btad136 |
| Sujets: | Sciences naturelles et génie > Sciences mathématiques > Informatique Sciences de la santé > Sciences médicales > Génétique |
| Département, module, service et unité de recherche: | Départements et modules > Département des sciences fondamentales Départements et modules > Département des sciences humaines |
| Mots-clés: | Genetics, software, humans, population analysis, haplotypes |
| Informations complémentaires: | Availability and implementation: The latest update of the GENLIB package (v1.1.9) contains the new gen.simuHaplo() function and is available on the CRAN repository and from https://github.com/R-GENLIB/GENLIB. Examples can be accessed at https://github.com/R-GENLIB/simuhaplo_functions. |
| Déposé le: | 07 mai 2024 21:13 |
|---|---|
| Dernière modification: | 07 mai 2024 21:13 |
Éditer le document (administrateurs uniquement)
Altmetric
Altmetric